機(jī)器學(xué)習(xí)新算法,可快速計算藥物與靶點間結(jié)合能力
來源:科研圈
發(fā)布時間:2021-03-18
瀏覽次數(shù):1318
美國麻省理工學(xué)院團(tuán)隊發(fā)明了一種新的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,可以通過精確、快速計算結(jié)合自由能來計算候選藥物與其靶點間的結(jié)合能力。

?

image.png

圖片來源:MIT News, Xinqiang Ding and Bin Zhang

?

藥物只有與目標(biāo)蛋白相結(jié)合才能發(fā)揮作用,而評估這種結(jié)合能力是藥物發(fā)現(xiàn)和篩選過程中的一個關(guān)鍵障礙。該能力由結(jié)合自由能衡量,結(jié)合自由能越小,結(jié)合能力越大。近日,美國麻省理工學(xué)院(MIT)團(tuán)隊發(fā)明了一種新的機(jī)器學(xué)習(xí)算法 DeepBAR,可以通過精確、快速計算結(jié)合自由能來計算候選藥物與其靶點間的結(jié)合能力。該算法通過在被稱為深度生成模型的機(jī)器學(xué)習(xí)框架中部署 Bennett acceptance ratio(BAR,一種幾十年來用于計算結(jié)合自由能的算法),來削減耗時的中間狀態(tài),并借鑒計算機(jī)視覺領(lǐng)域的經(jīng)驗,使得該算法與之前最先進(jìn)的方法相比,只需少量時間就能產(chǎn)生精確的計算結(jié)果。在使用小蛋白類分子的測試中,DeepBAR 計算結(jié)合自由能的速度比之前的方法快近 50 倍。研究人員表示,DeepBAR 可以加速新藥研發(fā)和蛋白質(zhì)工程的進(jìn)步,并計劃提高 DeepBAR 運行大型蛋白質(zhì)計算的能力。該研究于 3 月 16 日在《物理化學(xué)通訊雜志》(Journal of Physical Chemistry Letters)發(fā)表。(MIT, Journal of Physical Chemistry Letters)


關(guān)注【深圳科普】微信公眾號,在對話框:
回復(fù)【最新活動】,了解近期科普活動
回復(fù)【科普行】,了解最新深圳科普行活動
回復(fù)【研學(xué)營】,了解最新科普研學(xué)營
回復(fù)【科普課堂】,了解最新科普課堂
回復(fù)【科普書籍】,了解最新科普書籍
回復(fù)【團(tuán)體定制】,了解最新團(tuán)體定制活動
回復(fù)【科普基地】,了解深圳科普基地詳情
回復(fù)【觀鳥知識】,學(xué)習(xí)觀鳥相關(guān)科普知識
回復(fù)【博物學(xué)院】,了解更多博物學(xué)院活動詳情

聽說,打賞我的人最后都找到了真愛。